Neste artigo faz-se um apanhado sobre as origens e a evolução histórica do pensamento agroecológico, ressaltando as principais concepções teóricas e suas bases epistemológicas e metodológicas, construídas sobre a crítica ao modelo convencional de desenvolvimento e agricultura. Propõem-se ainda as diretrizes para a construção de programas de desenvolvimento rural sustentável com enfoque agroecológico. O apanhado histórico da agroecologia identifica duas correntes de pensamento agroecológico exercendo forte influência sobre cientistas e agricultores redor do mundo. Expõem-se diversas definições de agroecologia, sendo retratada como uma ciência em plena construção a qual exige dos cientistas vinculados ao seu desenvolvimento uma postura aberta e pouco dogmática. Definem-se e comentam-se os diversos conceitos inerentes à agroecologia, como o agroecossistema, a co-evolução e o potencial endógeno. As reflexões sobre as bases metodológicas mostram os caminhos percorridos pelo pensamento sistêmico nas ciências agrícolas convencionais e definem três perspectivas agroecológicas de pesquisa, sendo a Investigação/Ação Participativa o método central da agroecologia. Considera-se que deve haver
uma disposição permanente em promover esse enfoque nos centros de pesquisa e desenvolvimento por meio de esforços interdisciplinares que integrem, na prática, as disciplinas que foram separadas pelo desenvolvimento da ciência convencional. A pesquisa agroecológica, finalmente, deve articular ONGs, movimentos sociais, setores públicos e empresariais para aumentar o espaço da agroecologia na construção do desenvolvimento rural sustentável.